《蚁人2》讲述的是复仇者联盟内战之后的故事。片中，因为参加了复仇者联盟内战，且站在了美国队长一遍，所以斯科特被FBI认为是危险人物，被禁足在了家中。

对于这样的生活，斯科特很是自得其乐。虽然被禁足家中，但是他学习魔术、看小说、唱歌，还有前妻一家人时不时的上门问候，以及能够时不时的看到自己的女儿，享受到了亲人的问候与温暖。这些，都让他无比满足和快乐。
但是这种安逸感在皮姆博士和女儿打开空间隧道后发生了变化。
偶然发现的斯科特，看到了在时空隧道中发生的事情，想起了量子世界的情景，看到了和女孩子玩捉迷藏。带着种种疑惑，他将这一发现告知了皮姆博士。

当时，皮姆博士和他的两个女儿正在研究通过时空隧道找到珍妮，把她带回到现实世界的方法。听了斯科特的发现，父女俩明白了事情的严重性。再次找到阿里人，让他们合作，把珍妮带出量子世界，
斯科特拒绝了。但皮姆博士利用斯科特加入复仇者联盟的罪恶感，从道德上绑架了斯科特，并接受了皮姆博士和霍普的要求。

就在一切准备都快要结束的时候，突然出现的幽灵女孩和FBI的人打破了这种平静，把珍妮从量子区域带回来，这条简单的道路变得复杂起来。想从女孩子那里得到幽灵和fbi的皮姆·贝尔白的人博士的实验室，一窥量子领域的神秘。
实验室争夺战的三方战争开始了。

幽灵女父亲是和皮姆一起工作的同事，共同研究量子领域。皮姆？维贝克因为两人的意见不合，博士解雇了他。但是幽灵女之父仍然根据自己的研究，量子异常，死亡，幽灵女也半人半鬼的身姿。除了通过量子治疗恢复正常以外，别无他法。
继斯科特一行重新夺回实验室后，量子隧道再次被打开，他们一行也终于在珍妮的量子空间中找到了具体的位置。皮姆·维贝克博士乘斯科特、霍普和幽灵，通过打架的女人和fbi的时间，通过量子寻找隧道的前妻。

影片的最后，斯科特·霍普终于和fbi的人——菲尔·贝克博士也从量子空间回到了珍妮特。幽灵女，对他们来说，通过不追杀她的珍妮混沌量子技术，治好了她的病，但却不再受她的欢迎。