埃博拉Ebola 的一篇review 本文仅包含埃博拉病毒的病毒分类、病毒特征、流行病学以及生态学特征、疾病和发病机制、以及诊断。粗略翻译仅供参考与学习。
埃博拉病毒(EBOV)是丝状病毒科中最知名和研究最广泛的成员，远早于2013-2016年令人震惊的西非大流行(epidemic)。1982年定义了病毒学分类，属于丝状病毒科(Filoviridae)，随后定期进行修订以适应变化。 1,2 这些修订以及常用术语的不幸重名使得丝状病毒的分类令人困惑。现在，EBOV指的是埃博拉病毒属中扎伊尔埃博拉病毒型的特定成员病毒。（图1）
丝状病毒(filoviruses)的历史主要涉及人类爆发(图1)。马尔堡病毒(Marburg virus,MARV)是在1967第一次被发现的丝状病毒。3 埃博拉病毒和苏丹病毒(Sudan virus,SUDA)分别于1976年在刚果民主共和国(DRC)和南苏丹共同被发现。4,5 随后，发现另外两种埃博拉病毒对人类具有致病性：1994年在科特迪瓦(Côte d’Ivoire)发现的Taï Forest virus (TAFV)和2007年在乌干达(Uganda)地区发现的本迪布焦病毒(Bundibugyo virus,BDBV)。6,7 雷斯顿病毒(Reston virus,RESTV)，1989年至1990年从菲律宾输入美国，长期以来一直是个例外，因为它只亚临床地感染人类。8,9 出乎意料地是，它出现在了菲律宾的猪身上，并在中国猪身上检测到RESTV序列，这引起了人们对食品安全的担忧。10,11 RESTV人兽共患性的潜在性尚未明确，并且迫切需要对这种潜在性进行研究调查。
最近，在蝙蝠(bat)和鱼类中发现了新的丝状病毒的基因组。Lloviu病毒(Lloviuvirus,LLOV)，cuevavirus属，是从西班牙和匈牙利的蝙蝠(学名：Miniopterus schreibersii)中获得的序列。Měnglà病毒(Měnglàvirus,MLAV)的序列是在中国的果蝠种(rousettus species)中发现，代表着一种新的病毒属，dianlovirus。13 在塞拉利昂(Sierra Leone)，几内亚(Guinea)，和肯尼亚(Kenya)的蝙蝠中发现了Bombali 病毒(BOMV)序列；该病毒被认为是一种新的埃博拉病毒。14 最后，源自鱼的丝状病毒构成了两个新属的成员，striavirus和thamnovirus.2,15 由于没有有效的分离物，这些新的丝状病毒未知的人兽共患性以及潜在致病性是一个公共卫生问题。
Virologic Features
丝状病毒是由包膜包裹着带有非节段的单负链RNA基因组的丝状颗粒。(图1)2,16-18 基因组RNA是由核蛋白(nucleoprotein)包裹，与聚合酶L、聚合酶辅助因子病毒蛋白(VP)35、以及转录因子VP30，共同构成具有复制酶和转录酶功能的核衣壳(nucleocapsid)。该结构与核蛋白相关的VP24相互作用，并被基质蛋白VP40所包围，后者是病毒颗粒形成的驱动力。病毒刺突(spike)是由单一的三聚体跨膜糖蛋白组成，介导病毒得进入宿主细胞，它也是宿主免疫反应的一个重要靶点。2,16-18 对于所有的埃博拉病毒，不像马尔堡病毒，RNA编辑能够导致糖蛋白的表达。糖蛋白基因的主要产物是一种分泌的，无结构的，可溶性性糖蛋白，参与抗原的破坏。16
丝状病毒在它们靶细胞的细胞质中进行复制。16-18 病毒颗粒通过糖蛋白与多种附着因子(如，C型凝集素)结合而吸附于细胞表面，主要以大胞饮的形式进入细胞。随后，半胱氨酸蛋白酶在内体中裂解糖蛋白，使其与受体Niemann–Pick C1结合并开始膜融合。这一过程将基因组释放到细胞质中，病毒复制酶的复制和转录通过一个互补正链RNA的中间体进行，该中间体作为子代负链RNA的模板。病毒正链RNA的转录产物由宿主核糖体翻译，引导细胞内核衣壳的组装并以出芽的方式释放到细胞外。2,16-18
关于丝状病毒的认识大多数是基于对EBOV和MARV的研究，但是人们认为所有的丝状病毒在细胞生物学中都遵循着类似的原理的同时也具有某些区别，例如基因组结构的改变，干扰素拮抗特性，以及RNA编辑。2,16-18 多年来，EBOV和BARV的生命周期建模系统已经建立，可以在1级和2级生物安全实验室中安全使用。17 这些系统有利于了解丝状病毒复制，并将促进治疗药物的开发。今后的重心将专注于研究这些病毒与新发现的具有未知致病潜力的丝状病毒之间的差异。
Epidemiologic and Ecologic Features
丝状病毒是保存在储存宿主（可能是蝙蝠）的人兽共患病原体，偶尔会波及人类和其他哺乳动物，这些动物可能是终宿主，中间宿主抑或是扩增宿主。(图2)19 然而，这一概念只适用于从埃及果蝠(学名:Rousettus aegyptiacus)中分离出来的MARV。20 多个蝙蝠物种被认为是埃博拉病毒的藏身之处，但均未成功分离病毒。21 这是相当罕见的，可能是由于低病毒载量，细胞系的低敏感性，或者是蝙蝠组织的抑制作用。由于蝙蝠在非洲国家可能被猎杀作为食物，22 缺失对储存宿主的识别是预防措施方面的一个问题。
人类致病的丝状病毒似乎在非洲赤道附近具有兽疫性。(图1)EBOV大多数在中非和西非引起大爆发，而SUDV,BDBV以及MARV和RAVV更可能在东非引起疾病。16 RESTV已知在菲律宾流行，并有可能在亚洲的任何地区流行。9 随着病原检测的程序不断地进行，将会有新的丝状病毒被发现。对人类致病潜力的评估将有助于确定这些丝状病毒对人类公共健康造成的威胁。因为用于建模和预测疾病爆发的工具已变得更加先进，未来的研究应该能够专注于预测丝状病毒的出现以促进公共卫生预防。
Disease and Pathogenesis
这个临床疾病不再被称为埃博拉或马尔堡出血热，而是埃博拉病毒病或马尔堡病毒病(EVD或MVD)，它能更好地反映了各种不同的症状并淡化出血热作为临床特征的重要性。潜伏期为2-21天(通常为6-10天)，可能取决于感染的丝状病毒以及暴露的量和感染途径。18,25,26 最初，感染表现为一种非特异性的发热性疾病，其特征为不适，乏力以及肌痛，几天后，许多病人会发展为胃肠道症状，包括厌食，恶心，呕吐以及腹泻(图3)。每天有高达10升的液体大量流失。其他常见的体征和症状有吞咽困难，头痛，结膜充血，腹部疼痛，关节痛以及斑丘疹。只有不到一半的患者会出现异常出血，通常表现为牙龈出血，瘀点，静脉穿刺部位渗出，结膜下出血以及呕血和便血。18,25-27
丝状病毒感染通常始于病毒颗粒在黏膜或是皮肤上的沉积；偶尔经皮感染。18 当病毒颗粒被树突状细胞以及巨噬细胞吞入后，丝状病毒复制通过阻断干扰素的产生以及信号传导从而有效地制止了早期固有免疫反应。28,29 扩散可能通过树突状细胞向淋巴组织的迁移和病毒释放入循环，导致肝脏、脾脏和其他组织中的固有巨噬细胞感染。然后感染扩散至临近的肝细胞，成纤维细胞和其他细胞。18,26,28-30
疾病是由病毒的复制和宿主对感染的反应的直接影响所引起的。18 病毒的复制会引起细胞内包涵体的形成，然后细胞裂解。30,31 肝内出现坏死岛，并伴有肝酶水平的相应升高。肌炎会引起肌肉酸痛和乏力，伴随着肌酸激酶和谷草转氨酶水平的升高。肾小管细胞和肾小球上皮均会受累，导致肾功能不全。(图3)宿主对感染的反应包括被感染的树突状细胞、巨噬细胞和单核细胞产生促炎因子和趋化因子。28-30,32 这些免疫反应会引起T细胞活化，但在严重或者致命的情况下，由于T细胞衰竭或凋亡，致使T细胞失效。促炎介质会引起内皮细胞功能紊乱，引起血管通透性增加和体液外渗。18,26,28,29,32 被感染的巨噬细胞在脾，淋巴组织，肾小球和肾近端小管中产生组织因子并伴有纤维蛋白沉积。凝血因子消耗(来自播散的微血栓)，血管内皮细胞损伤以及血小板功能抑制均可导致凝血功能障碍。18,26,28-30,32 微血管异常，低血容量，以及呕吐和腹泻导致的体液进一步流失最终导致组织灌注不足和多器官衰竭。18,26,28,29,32
在2013-2016年埃博拉病毒流行期间，在幸存者中发现肌肉骨骼疼痛，头痛，脑炎和眼部疾病，这些被统称为“后埃博拉综合征”。33 历史上，在感染幸存者的多种体液中检测出丝状病毒，包括breast milk和 semen 。在发病超过500天后semen具有传播的可能性是一个严重的问题。但是患病后这么长时间还具传染性的情况是极其罕见的，具有不确定的影响。34-36
Diagnosis
已经建立了多种丝状病毒检测的实验室诊断方法，包括检测病毒基因组，病毒抗原检测，以及宿主免疫反应检测(抗体检测)，甚至在现场检测。37,38 在西非EBOV流行中，实施现场高端测序技术可提高对疫情的应对能力。39 此外，在床边进行病毒抗原的简单检测已成为可能。37,38 诊断急性感染最广泛使用的技术的实时定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)，最好针对两个不同的基因组位置，以减少由于进化的基因组突变导致的假阴性结果。qRT-PCR预计在有症状的患者中呈现阳性，在致命病例中随着病毒学症增加呈现阳性。由于检测在病程早期呈阴性，但是，对于最初检测呈阴性但症状一直持续的患者后续的检测的必要的。在过去，从治疗中心出院至少需要连续两次检测试验结果阴性。尽管实验室诊断有所改善，但个体EVD或MVD病例可能仍然难以诊断，因此临床评估非常重要。在一些配备不足的初级卫生保健环境中，由于缺乏技术能力，进一步诊断会受到阻碍。在许多的非洲国家技术传授以及培训仍处于初步阶段，但是人们对丝状病毒已经提高，并且有了更简单更可靠的技术，会有一个改进的前景。
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